8 октября, в канун памяти святого апостола и евангелиста Иоанна Богослова, в храме при Саратовской православной духовной семинарии было совершено всенощное бдение. 9 октября была отслужена Божественная Литургия, а после нее совершен молебен апостолу и евангелисту Иоанну Богослову. Богослужение возглавил первый проректор семинарии, проректор по учебной работе игумен Варфоломей (Денисов).Как и во всяком духовном учебном заведении Русской Православной Церкви центром духовной жизни и воспитательного процесса в деле подготовки будущих пастырей Церкви является храм семинарии. Домовая церковь апостола и евангелиста Иоанна Богослова была освящена 6 октября 1885 года епископом Саратовским и Царицынским Павлом (Вильчинским). Храм находился в середине здания, в бельэтаже высотою в два этажа, занимая обширную и почти квадратную территорию. В храме имелся резной дубовый иконостас, иконы в который написал художник Лев Степанович Игорев. Имеется историческое свидетельство о посещении в 1891 году здания новой семинарии обер-прокурором Святейшего Синода К.П. Победоносцевым, на которого семинарский храм произвел "весьма приятное впечатление своей изящной простотой (иконостас дубовый без позолоты) и художественным стилем иконной живописи".Интересным историческим пересечением между храмом Саратовской семинарии и храмом Санкт-Петербургской семинарии стало не только то, что они были освящены в честь апостола и евангелиста Иоанна Богослова и спроектированы одним и тем же архитектором Николаем Никифоровичем Марковым (1815-1885) но и то, что при них действовали братства помощи неимущим студентам.После октябрьского переворота 1917 года была реквизирована большая часть семинарских помещений и имущества, а в сентябре 1918 года семинария была закрыта. После закрытия духовной школы в 1918 году храм был разгромлен. Здание семинарии было передано Педагогическому институту. Помещение храма было разделено межэтажным перекрытием и в нем были устроены учебные аудитории.В 2008 году здание семинарии передано в безвозмездное пользование Саратовской Епархии Русской Православной Церкви, после чего началась его реконструкция. 9 октября 2013 года, в день памяти апостола и евангелиста Иоанна Богослова, в возрожденном семинарском храме была совершена первая Божественная литургия, которую возглавил Митрополит Саратовский и Вольский Лонгин.26 октября 2014 года, в неделю 20-ю по Пятидесятнице, Святейший Патриарх Московский и всея Руси Кирилл, во время своего визита в Саратовскую митрополию, совершил Великое освящение храма во имя святого апостола и евангелиста Иоанна Богослова при Саратовской православной духовной семинарии и Божественную литургию в новоосвященном храме.Храм является центром семинарской жизни. Здесь будущие священнослужители учатся на деле тому, что будет главным в их жизни – молитве и богослужению. На клиросном послушании семинаристы учатся церковному пению и чтению. Студенты поочерёдно помогают в храме, следя за ходом священнодействий, совершаемых в алтаре, старшие курсы произносят проповеди.